介绍 Maspectra

我们非常高兴推出 Maspectra®，它能够帮助您加速药物开发的建模和仿真过程。

Maspectra® 旨在成为一个在性能、易用性和可扩展性方面表现出色的数据分析平台，专门满足药理学和统计功能的多样化需求。

我们的开发主要集中在两个方面：一个基于 Python 的建模框架，名为 masmod，以及一个跨平台的软件图形用户界面。

masmod 框架

masmod 是一个高性能的药代动力学/药效学 (PK/PD) 建模与仿真框架，具有精心设计的 Python 接口。它提供了一系列工具，包括探索性数据分析、模型定义/估算/评估和仿真。

masmod 的语法遵循广泛认可的 Python 风格，学习和使用起来非常简单。其可扩展性使得您可以轻松将自己的模型纳入定制的 masmod 模型库中。

编写和读取 masmod 模型就像编写和阅读数学方程一样简单。您还可以使用 masmod 进行模型仿真并可视化结果。如果您有使用知名机器学习框架 PyTorch 的经验，您会发现语法上的相似之处，使其直观且易于访问。

Show me a demo!

/models/warfarin_final.py

class DemoPopPKProblem(Module):


    def __init__(self):
        super().__init__()

        # pk parameters
        self.tv_v = theta(8.06, bounds=(0.01, 20))
        self.tv_cl = theta(0.131, bounds=(0.01, 1))
        self.tv_ka = theta(1.325, bounds=(0.01, None))
        self.tv_alag = theta(1.03, bounds=(0.01, 24))
        self.eta_v = omega(0.016744)
        self.eta_cl = omega(0.0662868)
        self.eta_ka = omega(0.452064)
        self.eta_alag = omega(0.302627)
        self.eps_prop_pk = sigma(0.00478)
        self.eps_add_pk = sigma(0.135)

        # Compartments
        self.dose_cmt = compartment(default_dose=True)
        self.central_cmt = compartment(default_obs=True)

        # From Data Input
        self.wt, self.dvid = column(['WT', 'DVID'])

    def pred(self):
        cl = self.tv_cl * (self.wt / 70)**0.75 * exp(self.eta_cl)  # Clearance
        v = self.tv_v * (self.wt / 70) * exp(self.eta_v)  # Volume
        ka = self.tv_ka * exp(self.eta_ka)  # Absorption rate
        alag = self.tv_alag * exp(self.eta_alag)  # Absorption lag time
        k20 = cl / v

        self.dose_cmt.alag = alag  # Alag on dosing compartment
        cp = self.central_cmt.A / v  # Central compartment concentration
        self.dose_cmt.dAdt = -ka * self.dose_cmt.A  # Dose compartment dynamics
        self.central_cmt.dAdt = ka * self.dose_cmt.A - k20 * self.central_cmt.A  # Central compartment dynamics

        y = cp * (1 + self.eps_prop_pk) + self.eps_add_pk  # Additive and proportional error
        return y

如果您对 masmod 感兴趣，请查看我们的 快速入门指南 以获取更多详细信息。

Maspectra® 图形用户界面

Maspectra® 是用于建模和仿真工作流的桌面软件。它提供了一个图形用户界面（GUI），作为 药物发现与开发的建模信息管理（MID3） 的集成开发环境（IDE）。

它是 MID3 工作流的一体化解决方案，涵盖药代动力学/药效学建模、统计分析、数据处理/可视化等。该软件是跨平台的，支持 Windows 和 macOS（Linux 版本正在开发中）。

我们将在后续博客中提供更多有关 Maspectra® 软件的详细信息，请继续关注我们 👀！

这是本博客的第一篇文章，感谢阅读。我们将持续更新此博客，与你分享我们的进展。如果您对我们的项目感兴趣，请在 GitHub 上关注我们。同时，我们也将在此发布更多有趣的内容，敬请期待！

提示

我们建议您 加入我们的候补名单，以便在 Maspectra® 公开发布后第一时间体验。